Николай родился 14 декабря 1921 года в селе Букреевица под городом Вятка (с 1934 года Киров) в многодетной крестьянской семье. Окончил школу, работал в местном колхозе. В 1940 году был призван в Красную Армию и направлен на учебу в военную школу младших авиаспециалистов в город Умань. Шишкин успешно прошел программу подготовки и в мае 1941 года был направлен мотористом в 254-й истребительный авиаполк под Киев. В этой должности младшего сержанта и застала война. В 1941 году под Киевом Красная Армия потерпела поражение, значительные советские силы оказались в окружении. В этих боях Шишкин попал под минометный обстрел и получил ранение в ногу. Николай не мог идти, поэтому товарищи перед отступлением оставили его в одной из местных хат. Вот что ветеран вспоминал об этом: Ну, а куда нас раненых? Нас оставили в домах. Меня укрыла женщина. Ее звали Ганна. У нее было четверо детей. Началась облава. Она нас спрятала в огороде, где у нее росла кукуруза. Со мной она отправила девочку Наташу лет пяти. Там мы укрылись. Хорошо, что облава была без собак. Через три часа облава снова пошла. Ганна не успела меня вывести. Деваться некуда. Она накрыла стол, посадила мне девочку на колени. Зашли два вражеских солдата. Ганна сказала, что у нее только дети». Раненый младший сержант был спасен местными жителями, встал на ноги и пробрался к своим. Шишкин вернулся в строй и продолжил службу в ВВС. Николай обслуживал бомбардировщики Пе-2, участвовал в боях Юго-Западного, Сталинградского, 1-го Украинского фронтов. День Победы он встретил в Австрии. В послевоенное время демобилизовался, женился на девушке, которую полюбил еще в школе. Молодая семья переехала в Архангельск, Николай Федорович служил на Северном флоте. В 1970 году он был переведен на должность главного инженера комбината бытового обслуживания, а затем стал его директором. Свою трудовую деятельность завершил на посту управляющего треста бытовых предприятий Архангельска Шишкин продолжил трудится и после выхода на пенсию. В 2001 году переехал в Нижний Новгород. Николай Федорович Шишкин занимал активную жизненную позицию, работал в Совете ветеранов, принимал участие в военно-патриотическом воспитании подрастающего поколения. За свои заслуги был награжден медалями и орденами.