С началом Великой Отечественной войны Васильева Е.М.назначили секретарем сельского Совета, а через месяц ушел на фронт. После небольшой подготовки попал в отдельный лыжный батальон. И уже в декабре в составе этого батальона был заброшен в тыл врага. Немало дорог прошагали за линией фронта, совершая налеты, диверсии, сея панику среди врагов в глубоком тылу. Однажды, находясь в разведке с группой товарищей, в деревне наткнулись на немецкий обоз, уничтожили охрану и захватили офицера с ценными документами. За этот бой Васильев Е.М. получил первую награду – орден Красной Звезды.  Перед одним из боев под городом Ржевом вступил в партию. И в этом бою получил тяжелое ранение. После двухмесячного лечения в госпитале, продолжал воевать в 17-й гвардейской армии. Кто-то в штабе обратил внимание на каллиграфический почерк Васильева Е.М.и предложил работать в штабе. Но это не говорит о том, что наступила спокойная служба, штабистам часто приходилось участвовать в боях. Был случай, когда штаб оказался отрезанным от основных частей и попал в окружение, быстро заняв  круговую оборону,  с боем держались до прихода наших войск. За этот бой Егор Михайлович был награжден орденом Отечественной войны I степени.  В 1944 году окончил дивизионную партшколу. В составе 17 армии закончил войну под Кенигсбергом. Через некоторое время перебросили на Дальний Восток. Пришлось повоевать и с японскими самураями. После капитуляции Японии, до октября 1946 года служил на Дальнем Востоке.